口腔是一个充满各种微生物的环境，而牙菌斑就像是由不同细菌组成的“细菌社区”，这些“社区”定居于牙面、牙与牙之间或者在假牙（义齿、修复体）表面。由于“社区”扎根很牢固，所以不能被水冲去或者漱掉，只能由机械方法清除。 牙菌斑主要对牙和牙龈构成危害，也就是口腔x常见的两种疾病：龋病和牙周病。
龋病俗称“虫牙”，这里的“虫”指菌斑中的细菌。牙菌斑牢固地附着在牙面上，细菌摄入唾液中的糖，分解糖产酸，这些酸会破坏牙齿，x终成洞。
当牙菌斑靠近牙龈时，细菌产生的毒素和其他有害物质会刺激牙龈（俗称“牙肉”、“牙床”），产生炎症，即牙龈炎。如果不加控制，任其发展，牙龈炎有可能会发展为不可逆的牙周炎，引起牙槽骨的破坏，x终导致牙齿松动、脱落。
