在青春后期，颌骨发育到接近成人大小。但有些人颌骨还不够大，没有足够位置供智齿萌出。智齿就会阻生在颌骨内，向其他方向生长。可能只有部分牙冠露出牙龈，或完全埋在颌骨里。牙根可能变形或向上颌窦或下颌骨神经所在部位生长，这很危险。 如果智齿长不出来，横长在了，就叫水平阻生智齿，一般会挤到外边的牙，让外边的牙极度拥挤，容易牙疼。 由于空间不足，阻生的智齿就向各种不同的方向生长，一般与邻近牙齿形成角度。可以向着邻近牙齿生长（近中呈角阻生），远离邻近牙齿生长（远中呈角阻生），也可以水平或垂直阻生。

 智齿生长的位置特殊，给它的清洁和治疗带来许多问题，常引起的疾病有龋齿（俗称蛀牙）、牙周炎、牙髓炎：由于智齿在x里面，日常刷牙不容易清洁，容易产生蛀牙，且智齿往往由于萌发空间不足出现胀痛，还会侵犯邻牙，造成牙疼。由于没有对咬牙，有时智齿会过度萌发，进而影响咬合；还有时会萌发不足成为阻生齿，引起牙列不齐，冠周间隙感染，张口困难。智齿是第三大臼齿，对相邻的第二磨牙有重要影响。由于大多数智齿是前倾阻生的，约呈45度角顶在第二磨牙上，从而形成一个牙冠夹角，容易嵌塞食物，久之导致第二磨牙龋坏，甚至牙髓炎，就算没有那么严重也会影响第二磨牙的寿命。